معرفی نرم افزار XCrySDen
- توضیحات
- دسته: نمایش ساختارهای مولکولی و کریستالی
- بازدید: 5095
XCrySDen نرم افزاری برای ترسیم ساختارهای مولکولی و کریستالی است. با استفاده از این نرم افزار به سادگی می توان سطوح و کانتورهای مختلف را بر روی ساختارهای کریستالی سوار کرد و به صورت تعاملی تغییراتی در این سطوح داد. XCrySDen همچنین ابزارهایی برای آنالیز فضای reciprocal مانند انتخاب مسیرهای k در ناحیه برلیون برای رسم band-structure و ترسیم سطوح فرمی دارد.
قالب های فایل قابل پشتیبانی:
XCrySDen با قالب فایل های استاندارد ساختارهای مولکولی و کریستالی مانند XYZ و PDB سازگار است و همچنین دارای قالب اختصاصی خود (XSF) است. علاوه بر این، این نرم افزار می تواند ساختارهای مربوط به نرم افزارهای کوانتومی زیر را بخواند:
GAUSSIAN
QuantumEspresso
CRYSTAL
PWscf
WIEN2k
FHI98MD
ابزارهای ترسیم ساختارهای مولکولی:
XCrySDen تقریباُ دارای تمام امکاناتی است که از یک ترسیم کننده مدرن مولکولی انتظار می رود. برخی از این امکانات به شرح زیر است:
- نمایش ساختارهای مولکولی در مدهای مختلف شامل: سیمی، گوی و میله ای و فظاپرکن.
- نمایش نیروهای عمل کننده روی اتمها
- چرخش، جابجایی و بزرگ نمایی ساختارهای مولکولی
- ساخت انیمیشن
- اندازه گیری خواص زوایا و زوایایی پیچش بین اتمها
- نمایش سطوح و کانتورهای میدان های اسکالر
- نمایش میدان بردار به صورت پیکان
ابزارهای ترسیم ساختارهای کریستالی:
علاوه بر ابزارهای ذکر شده در بالا، XCrySDen دارای قابلیت هایی بیشتر برای ترسیم ساختارهای کریستالی است:
- امکان جابجایی بین سل های primitive و conventional
- تغییر تعداد سل ها واحد نمایش داده شده و نمایش قسمت های کوچکتر و بزرگتر از یک کریستال
- نمایش شبکه بلور (crystal lattice)
- نمایش سل Wigner-Seitz و ناحیه بریلیون (Brillouin Zone)
- انتخاب مسیر k برای محاسبات ساختار نوار (Band Structure)
- ترسیم سطوح فرمی