فهرست نرم افزارهای علمی
بسته نرم افزارهای کوانتومی
| نام نرم افزار: | امکانات: | پردازش موازی: | |
|---|---|---|---|
| NWChem 6.6 |
انواع محاسبات مکانیک کوانتومی در فاز گازی محلول و حالت جامد محاسبات مکانیک مولکولی روش های ترکیبی کلاسیک/کوانتومی دینامیک مولکولی کلاسیک دینامیک مولکولی کوانتومی توابع پایه گوسی و موج مسطح |
*SMP | جزئیات بیشتر |
| Gaussian 09 rev D |
انواع محاسبات کوانتوم مکانیکی در فاز گازی و محلول محاسبات مکانیک مولکولی روش های ترکیبی |
*SMP | جزئیات بیشتر |
| GAMESS 2014 + Tinker |
انواع محاسبات کوانتوم مکانیکی در فاز گازی و محلول محاسبات مکانیک مولکولی
|
*SMP | جزئیات بیشتر |
| NBO 5 |
محاسبه انتقال بار بین مولکول های مختلف و قسمت های مختلف یک مولکول محاسبه اوربیتال های طبیعی آنالیز برهمکنش های بین مولکولی |
SMP* / LCP** |
جزئیات بیشتر |
| Multiwfn 3.2 | آنالیز تابع موج و برهمکنش های بین مولکولی | **LCP | جزئیات بیشتر |
| SAPT 2012 + DFT SAPT | آنالیز برهمکنش های بین مولکولی | none | جزئیات بیشتر |
| Open Babel 2.2 | تبدیل و آنالیز فایل های شیمی و بیوشیمی | **LCP | جزئیات بیشتر |
| Gaussview 3 |
ساخت و نمایش ساختارهای شیمیایی و بیوشیمیایی ساخت فایل ورودی برای نرم افزار Gaussian |
***NCP |
جزئیات بیشتر |
| MacMolplt 7.5 |
ساخت و نمایش ساختارهای شیمیایی و بیوشیمیایی ساخت فایل ورودی برای نرم افزار |
***NCP | جزئیات بیشتر |
| Gabedit 2.4.7 |
ساخت و نمایش ساختارهای شیمیایی و بیوشیمیایی رابط کاربر گرافیکی برای بسیاری از نرم افزارهای محاسباتی |
***NCP | جزئیات بیشتر |
| Molekel 5.4 |
نمایش ساختار و سطوح مختلف ترکیبات شیمیایی و بیوشیمیایی |
***NCP | جزئیات بیشتر |
| Jmol 14 + Jmol NBO |
نمایش ساختارهای شیمیایی-بیوشیمایی و ساختارهای کریستالی |
***NCP |
جزئیات بیشتر |
| MOLDEN |
نمایش دانیسته مولکولی محاسبه شده با استفاده از انواع نرم افزارهای ab inito و نیمه تجربی نمایش دانسیته الکترونی و اوربیتال ها |
***NCP |
جزئیات بیشتر |
بسته نرم افزارهای دینامیک مولکولی
| نام نرم افزار: | امکانات: | پردازش موازی | |
|---|---|---|---|
| GROMACS 5 |
دینامیک مولکولی کلاسیک |
*SMP | جزئیات بیشتر |
| LAMMPS | دینامیک مولکولی کلاسیک | *SMP | جزئیات بیشتر |
| NWChem 6.6 |
انواع محاسبات مکانیک کوانتومی در فاز گازی محلول و حالت جامد محاسبات مکانیک مولکولی روش های ترکیبی کلاسیک/کوانتومی دینامیک مولکولی کلاسیک دینامیک مولکولی کوانتومی توابع پایه گوسی و موج مسطح |
*SMP | جزئیات بیشتر |
| NAMD 2.10 | دینامیک مولکولی کلاسیک | *SMP | جزئیات بیشتر |
| Open Babel 2.2 | تبدیل و آنالیز فایل های شیمی و بیوشیمی | **LCP | جزئیات بیشتر |
| Gabedit |
ساخت و نمایش ساختارهای شیمیایی و بیوشیمیایی رابط کاربر گرافیکی برای بسیاری از نرم افزارهای محاسباتی |
***NCP | جزئیات بیشتر |
| VMD 1.9 |
نمایش و آنالیز ساختارهای بزرگ زیستی و ماکرومولکول ها رابط کاربر گرافیکی برای نرم افزار NAMD |
***NCP | جزئیات بیشتر |
بسته نرم افزارهای حالت جامد
| نام نرم افزار: | امکانات: | پردازش موازی: | |
|---|---|---|---|
| Quantum Espresso 5.0.3 |
انواع محاسبات کوانتوم مکانیکی در فاز گازی و حالت جامد با استفاده از توابع پایه موج مسطح دینامیک مولکولی کوانتومی |
*SMP | جزئیات بیشتر |
| ABINIT 8.0.8 | انواع محاسبات کوانتوم مکانیکی در فاز گازی و حالت جامد با استفاده از توابع موج مسطح | *SMP | جزئیات بیشتر |
| NWChem 6.6 |
انواع محاسبات مکانیک کوانتومی در فاز گازی محلول و حالت جامد محاسبات مکانیک مولکولی روش های ترکیبی کلاسیک/کوانتومی دینامیک مولکولی کلاسیک دینامیک مولکولی کوانتومی توابع پایه گوسی و موج مسطح |
*SMP | جزئیات بیشتر |
| XCrySden 1.6 |
نمایش ساختارهای مولکولی و کریستالی نرم افزارهای Gaussian، Quantum Espresso، Crystal، PWscf، WIEN2K، FHI98MD نمایش انواع سطوح و کانتورها نمایش شبکه کریستالی، سل Weigner-Seitz و Brilloun-Zone انتخاب k-path برای محاسبات band-structure |
***NCP | جزئیات بیشتر |
| VESTA 3.3 |
نمایش و ساخت ساختارهای کریستالی نمایش داده های حجمی مانند چگالی الکترون و هسته نمایش مورفوگرافی بلور |
***NCP | جزئیات بیشتر |
| PWGui | رابط گرافیکی برای ساخت فایل های ورودی نرم افزار Quantum Espresso | ***NCP | جزئیات بیشتر |
| Gibbs2 |
رسم دیاگرام های فاز و نمودارهای ترمودینامیکی برای سیستم های حالت جامد در شرایط هیدرواستاتیک محاسبه معادلات حالت و خواص ترمودینامیکی سیستم های حالت جامد در شرایط هیدرواستاتیک |
**LCP | جزئیات بیشتر |
| Grace 5.1.22 | رسم انواع نمودارهای دو بعدی | ***NCP | جزئیات بیشتر |
| Open Babel 2.2 | تبدیل و آنالیز فایل های شیمی و بیوشیمی | **LCP | جزئیات بیشتر |
| Matlab 2013 |
انجام انواع محاسبات عددی زبان برنامه نویسی سطح چهارم دارای تعداد بالایی از توابع علمی و مهندسی |
*SMP | جزئیات بیشتر |
توضیحات:
* SMP: انجام محاسبه با استفاده از تمامی هسته های پردازنده
** LCP: محاسبات نرم افزار سبک است و نیازی به پردازش موازی ندارد
*** NCP: نرم افزار غیر محاسباتی است

